杰森·伯恩事件引起连锁反应，踏脚石（Treadstone）计划以及CIA用药物控制强化特工的行径通过报纸公之于众，令其幕后人物坐立不安。为了阻止满盘皆输的局面出现，CIA高层决定中止该计划，并将相关特工人员以及科学家从行动中抹杀。在此后的日子里，那些深藏在国家政治最底层、依靠蓝绿药丸执行各种绝密任务的特工相继殒命，而负责染脏双手的执行人——前美国空军上校艾瑞克·贝尔（爱德华·诺顿 Edward Norton 饰），正慢慢将屠刀伸向隐藏在位于阿拉斯加崇山峻岭、暴雪深山中的特工艾伦·克劳斯（杰瑞米·雷纳 J
在人间之外的天堂与地狱之战绵延不绝，双方都在为自己争取强力的战士。中情局特工西蒙斯（迈克尔·加·怀特 Michael Jai White 饰）厌倦了杀戮的任务，向上司威恩（马丁·辛 Martin Sheen 饰）提出退出，岂料却在朝鲜执行任务时被威恩害死。坠入地狱的西蒙斯与恶魔马里波吉亚达成协议，同意为它统率地狱军队来换得再生报仇的机会。被恶魔雪藏五年的西蒙斯再生回到人间，以再生侠之名示人，并在恶魔走狗——小丑的引领下向威恩复仇。此时研究生化武器着魔的威恩试图统治世界，而他的死亡会引发全球陷入生化灾难。
